整個(gè)清代，雖然難以找出具有劃時(shí)代意義的藥物學(xué)杰作，但也異常繁榮，至少在本草著作的數(shù)量上空前多，種類空前豐富。
(一)趙學(xué)敏的《本草綱目拾遺》
在醫(yī)學(xué)史上，但凡一部偉大著作產(chǎn)生之后，往往會伴隨著產(chǎn)生眾多的后續(xù)性著作。在《本草綱目》眾多后續(xù)性著作中，成就最大的無疑是清代趙學(xué)敏的《本草綱目拾遺》。趙學(xué)敏一成中寫過大量有關(guān)醫(yī)藥方面的著作，其中的《升降秘要》和《藥性玄解》是介紹煉丹方法的，實(shí)際上是研究制藥化學(xué)的專著；《本草話》是辨別藥物真?zhèn)魏彤a(chǎn)地的專著；《花藥卜名錄》專載藥物別名和隱名；《奇藥備考》是補(bǔ)充明代高廉所著《珍異藥品》的著作。可惜這些著作都已散佚無存。趙學(xué)敏畢生心血在藥物方面只留下《本草綱目拾遺》10卷尚流傳于世。
《本草綱目拾遺》的主要貢獻(xiàn)在于，他總結(jié)了《本草綱目》之后藥物學(xué)發(fā)展的成就。全書載藥921種，其中的716中為《本草綱目》所未載。這一數(shù)字超過了古代任何一部本草著作所新增添的藥物數(shù)，對李時(shí)珍的錯誤或不妥之處加以訂正。如《本草綱目》載鉛粉辛寒無毒，世人“皆仍其誤”，危害匪淺，趙學(xué)敏根據(jù)實(shí)地考查，證明這是錯誤的，并加以糾正。趙學(xué)敏對民間醫(yī)藥知識極為重視，他深入到民間勞動群眾當(dāng)中，虛心學(xué)習(xí)求教，采集了許多簡、便、廉的草藥和單方。如雞血藤舒筋活絡(luò)、鴉膽子治冷痢、千里光治瘡、鷓鴣菜驅(qū)蛔蟲、臭梧桐治頭風(fēng)、六月霜解暑毒等等都直接來源于民間經(jīng)驗(yàn)。他還記載了清以來傳入的藥物知識，如治療瘧疾的金雞勒、治療咽喉腫痛的胖大海、外用的日精油及東洋參、西洋參、煙草等等。還記載了一些西藥如消強(qiáng)水、刀創(chuàng)水、沖鼻水等。趙學(xué)敏編纂醫(yī)藥著作的目的是“可濟(jì)于世”，因而他治學(xué)態(tài)度極為嚴(yán)謹(jǐn)。因此《本草綱目拾遺》有很高的科學(xué)價(jià)值，是清代新內(nèi)容最豐富的本草著作之一，代表了清代本草學(xué)的最高成就。
(二)尊經(jīng)復(fù)古思潮下的本草著作
從明代繆希雍《本草經(jīng)疏》起，明清在藥物理論探討上出現(xiàn)了新的變更，其中有言本草必宗《本經(jīng)》的尊經(jīng)派，著力闡發(fā)《神農(nóng)本草經(jīng)》的藥物機(jī)理；有致力于《神農(nóng)本草經(jīng)》原文的輯復(fù)工作的；還有以張仲景所用藥物為研究對象，注疏“經(jīng)方”藥物的。這種尊經(jīng)復(fù)古傾向的產(chǎn)生與清代整個(gè)醫(yī)學(xué)界的復(fù)古思潮有關(guān)，與清政府禁固思想文化而產(chǎn)生的乾嘉考據(jù)學(xué)風(fēng)也有關(guān)。
1、注疏《神農(nóng)本草經(jīng)》藥物為主的本草著作
《本草祟原》為張志聰?shù)奈赐旮�，�?jīng)其門人高士繼續(xù)完成。他們從藥物生成、形色性味及與病因病機(jī)之間的關(guān)系入手分析藥理，切于實(shí)際，通俗易曉。
清代中葉另有姚球撰有《本草經(jīng)解要》一書，論藥著重在“藥與癥相應(yīng)”。把藥物氣味功效與人體臟腑功能緊密結(jié)合，與《本草祟原》殊途同歸。
乾隆年間著名醫(yī)家除大椿撰集了《神農(nóng)本草經(jīng)百種錄》，從辨藥物之形氣監(jiān)督來探討藥性，研討精深，多有新意。他針對當(dāng)時(shí)一些不明藥性、濫用藥品的時(shí)弊予以抨擊。
陳修園撰寫《神農(nóng)本草經(jīng)讀》時(shí)常結(jié)合張仲景用藥法，并結(jié)合自身豐富的臨床經(jīng)驗(yàn)，頗有建樹。綜上各家的共同特點(diǎn)都是在理論上尊經(jīng)崇古，但由于以上著作多出于臨床經(jīng)驗(yàn)豐富的名醫(yī)之手，故有不少寶貴的用藥經(jīng)驗(yàn)體會，頗有新的見地，所以流傳較廣。
2、對《神農(nóng)本革經(jīng)》等的輯復(fù)工作
《神農(nóng)本草經(jīng)》的輯佚始于南宋，至www.med126.com明代有盧復(fù)輯佚本。清代受考據(jù)學(xué)的直接影響，一些經(jīng)學(xué)家把其余力用在本草著作上，出現(xiàn)了一股小小的輯佚熱潮，孫星衍、孫馮翼所輯《神農(nóng)本草經(jīng)》是各種輯佚本中較突出的一部。孫星衍是清代著名考據(jù)學(xué)家，孫馮翼是他的學(xué)生，仰仗他們淵博的學(xué)識、豐富的資料和嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶W(xué)風(fēng)，二孫輯本受到廣泛重視，多次翻刻，影響較大。此后顧觀光在《神農(nóng)本草經(jīng)》藥物校勘和考證方面下了一定功夫，輯為新的本子，但其編排次序取自《本草綱目》所列《本經(jīng)》目錄，未為允當(dāng)。
此外清代對《吳普本草》、《雷公炮炙論》、《新修本草》都作了初步輯復(fù)工作。
3、注疏經(jīng)方藥物為主的本草著作
清代部分尊經(jīng)復(fù)古者專門討論《傷寒論》、《金匱要略》兩部經(jīng)典中的藥物。黃元御《長沙藥解》，取張仲景方書中161味藥，探討張仲景治病用藥機(jī)理。其特點(diǎn)是將論病與用藥議方結(jié)合起來，間附個(gè)人見解，對當(dāng)時(shí)醫(yī)學(xué)中的流弊也多加針砭。
鄒澍將張仲景所用173味藥予以疏證，編成《本經(jīng)疏證》。該書將藥物分為三品，除注疏藥性外，還在毒藥下論述了藥物基原，其特點(diǎn)是結(jié)合個(gè)人體會，把藥、方、病結(jié)合起來論述。
此外還有周巖《本草恩辨錄》吳槐綬《南陽藥證匯解》和田伯良《神農(nóng)本草經(jīng)原文藥性增解》也都著眼于張仲景用藥法的研究。
(三)《本草述》及后續(xù)著作
清初節(jié)纂改編《本草綱目》的著作中，劉若金的《本草述》影響較大。他將《本草綱目》進(jìn)行了刪節(jié)修訂，在80歲上撰成《本草述》一書。書共32卷，編排順序、藥品基本上都取自《本草綱目》大量吸收宋元以來醫(yī)家有關(guān)論述。該書論藥以談?wù)撍幮运幮Ъ八幚砣胧�，常于略引前人論說之后，附以大篇闡釋，對有些藥物解說辨析入微，頗有見地。
該書一問世，頗受歡迎。嘉慶間楊時(shí)泰對其進(jìn)行刪節(jié)修訂，增加了藥物基原、產(chǎn)地、性味、主治等內(nèi)容，使一部原為專述藥性的著作，一變成為適于臨床應(yīng)用的書籍，命名為《本草述鉤玄》。
在《本草述》基礎(chǔ)上改編而成的，還有陳其瑞的《本草撮要》，全書以藥為經(jīng)，以方為緯；體裁與《本草述鉤玄》相類似。另有張琦依據(jù)《本草述》節(jié)錄的《本草述錄》。其后蔣溶又在張琦節(jié)本基礎(chǔ)上再加輯補(bǔ)，成《萃金裘本草述錄》。張琦學(xué)生包誠在張琦節(jié)本藥物基礎(chǔ)上，以十二經(jīng)絡(luò)為經(jīng)，十劑為緯，列成《十劑表》。
(四)普及性本草著作
在清代400余部本草著作中，普及性本草書籍竟占大半，這不能說是完全正常的，但普及性本草著作中仍不乏高水準(zhǔn)之作。
清代流行最廣的普及性本草著作是汪昂的《本草備要》。他以《本草綱目》和《神農(nóng)本草經(jīng)疏》為基礎(chǔ)加以綜合節(jié)要而成。該書最大特點(diǎn)是實(shí)用，所選400種藥物皆常用之品；另一特點(diǎn)是通俗，解說簡明扼要，易懂易記。
吳儀洛的《本草從新》是《本草備要》的增補(bǔ)本。共錄藥物720種。分類編次悉同《本草備要》。補(bǔ)充了許多未見于本草著作記載的民間藥材。在藥物識別上他也根據(jù)體會予以記述，其次在產(chǎn)地、道地藥材、炮灸等方面都有新的見解。
其它如郭佩蘭的《本草匯》、張璐的《本草逢原》、黃宮繡的《本草求真》等等也各有特色。
清代方劑學(xué)與藥物學(xué)有類似的特點(diǎn)，即數(shù)量眾多，內(nèi)容豐富，且多短小精悍，適于應(yīng)用。同時(shí)對理法方藥和方劑配合意義的研究已更為普遍，水準(zhǔn)也不斷提高。
清代在方劑學(xué)方面影響最大的著作要首推汪昂的《醫(yī)方集解》。該書在分類編排上打破了過去方書以病癥分類的傳統(tǒng)，而采用根據(jù)方劑功效分門別類的方法，按補(bǔ)養(yǎng)、涌吐、發(fā)表、攻里、表里等21門歸納諸方。這樣既便于查閱，又避免了重復(fù)。每一具體醫(yī)方又分項(xiàng)分別論述介紹組成、方解、附方等，條理清晰，眉目分明。這種方法一直沿用至今。其次選方精煉。該書選取正、附方各300余首，選取原則是“諸書所共取，人世所常用”。由小見大，有精見博。所選方劑皆藥味簡潔，藥物平易者，便于實(shí)www.med126.com用。書中雖有少數(shù)峻猛之劑，亦為攻堅(jiān)奪病所必需者，而對冷僻，專治奇癥怪病或藥味超過20味以上者，則不收錄。其三議論有獨(dú)到見解，該書中作者個(gè)人發(fā)明則以“昂按”標(biāo)明。作者每每對待學(xué)術(shù)上的爭鳴直陳己見，影響深遠(yuǎn)。
吳儀洛鑒于《醫(yī)方考》和《醫(yī)方集解》各具優(yōu)缺點(diǎn)，綜合二書內(nèi)容，進(jìn)行了刪改補(bǔ)充，編成《成方切用》一書，影響亦較廣。
在清代眾方書中獨(dú)樹一幟的還有趙學(xué)敏的《串雅》內(nèi)外編。這是一部民間‘走方醫(yī)’(鈴醫(yī))的醫(yī)術(shù)方藥經(jīng)驗(yàn)匯編。趙學(xué)敏是一位獨(dú)具慧眼的科學(xué)家，將走方醫(yī)的秘不傳授的秘方整理保存下來。全書載方貫穿“賤、便、廉”的原則，高度評價(jià)走方醫(yī)的截、頂、串三da法。記載了許多卓有療效的經(jīng)驗(yàn)，如吳茱萸末貼足心治咽喉腫痛、雞血治娛蚣咬傷等等，至今仍在臨床使用。
費(fèi)伯雄著《醫(yī)方論》4卷，根據(jù)《醫(yī)方集解》方劑次序，逐方予以評述。王翊的《萬全備急方》多取山野常見草藥，適于僻壤窮苦之人。宋鴻雪的《方便方》，選古今名醫(yī)經(jīng)驗(yàn)單方匯集而成。陶承熹的《惠直堂經(jīng)驗(yàn)方》取祖父、外祖父平生所集錄的驗(yàn)方及他本人二十年間在各地所聞所得的各種成方。徐大椿把《傷寒論》中各方分成桂枝類、麻黃類、葛根類等十二類，以簡馭繁，綱舉目張，著成《傷寒類方》、許宏《金鏡內(nèi)臺方議》也專為闡發(fā)張仲景方義而作。清代較有影響的方書還有王子接《絳雪園古方選注》、王孟英的《潛齋簡效方》、年希堯《集驗(yàn)良方》、何夢瑤《醫(yī)方全書》等等不可勝計(jì)。
以歌訣形式普及方劑內(nèi)容的著作在清代也有很多，如汪昂的《湯頭歌訣》選方290首，編成200余首七言歌訣，每首歇訣之下還有簡要注釋。該書亦流行甚廣。陳修園編有《長沙方歌括》、《金匱方歌括》、《時(shí)方歌括》等。
