（三)胞漿（Cytoplasm)是無色透明膠狀物，基本成份是水、蛋白質(zhì)、脂類、核酸及少量無機(jī)鹽。細(xì)胞漿中還存在一些胞漿顆粒。
1．質(zhì)粒（Plasmid)這是染色體外的遺傳物質(zhì)，為雙股環(huán)狀DNA。分子量比染色體小，可攜帶某些遺傳信息，例如耐藥因子、細(xì)菌素及性菌毛的基本均編碼在質(zhì)粒上。質(zhì)粒能進(jìn)行獨(dú)立復(fù)制，失去質(zhì)粒的細(xì)菌仍能正常存活。質(zhì)�？赏ㄟ^接合、轉(zhuǎn)導(dǎo)作用等將有關(guān)性狀傳遞給另一細(xì)菌。
2．核糖體（Ribosome)電鏡下可見到胞漿中有大量沉降系數(shù)為70S的顆粒，即核糖體。其化學(xué)組成70%為RNA，30%為蛋白質(zhì)。細(xì)胞中約90%的RNA和40%的蛋白質(zhì)存在于核糖體中。當(dāng)mRNA連成多聚核蛋白體（Polyribosome),就成為合成蛋白質(zhì)的場所。細(xì)菌的70S核糖體由50S和30S兩個(gè)亞基組成。鏈霉素能與細(xì)菌核糖體的30S基結(jié)合，紅霉素能與50S亞基結(jié)合，從而干擾細(xì)菌蛋白質(zhì)的合成而導(dǎo)致細(xì)菌的死亡；真核細(xì)胞的核糖體為80S，因此對人體細(xì)胞則無影響。
3．胞漿顆粒（Cytoplasma granula)大多數(shù)為營養(yǎng)貯藏物，較為常見的是貯藏高能磷酸鹽的異染顆粒（Metachrometic granula)，嗜堿性較強(qiáng)，用特殊染色法可以看得更清晰。根據(jù)異染顆粒的形態(tài)及位置，可以鑒別細(xì)菌。
（四)核質(zhì)（Nnclear materal)或擬核(Nucleoid)是細(xì)菌的遺傳物質(zhì)，決定細(xì)菌的遺傳特征。集中在細(xì)胞漿的某一區(qū)域，多在菌體中部。它與真核細(xì)胞的細(xì)胞核不同點(diǎn)在于四周無核膜，故不成形，也無組蛋白包繞。一個(gè)菌體內(nèi)一般含有1～2個(gè)核質(zhì)。現(xiàn)已證明，細(xì)菌的核質(zhì)是由雙股DNA組成的單一的一根環(huán)狀染色體反復(fù)回旋盤繞而成，細(xì)菌的染色體是裸露的DNA。
大腸桿菌的染色體分子量為3×109，伸展后長度約達(dá)1.1mm，約含5×106堿基對，足可攜帶3，000～5，000個(gè)基因，以滿足細(xì)菌生命活動(dòng)的全部需要，核質(zhì)具有細(xì)胞核的功能，控制細(xì)菌的各種遺傳性狀。細(xì)菌胞漿中含有大量RNA，用堿性染料染色著色很深，將核質(zhì)掩蓋，不易顯露。若用酸或RNA酶處理，使RNA水解，再用富爾根（Feulgen)氏法染色，便可染出核質(zhì)，在普通光學(xué)顯微鏡下可以看見，一般呈球狀、棒狀或啞鈴狀。
二、特殊結(jié)構(gòu)
細(xì)菌的特殊結(jié)構(gòu)包括莢膜、鞭毛、菌毛和芽胞。
（一)莢膜（Capsule)許多細(xì)菌胞壁外圍繞一層較厚的粘性、膠凍樣物質(zhì)，其厚度在0.2um以上，普通顯微鏡可見，與四周有明顯界限，稱為莢膜。如肺炎雙球菌（圖2-7)。其厚度在0.2um以下者，在光學(xué)顯微鏡下才不能直接看到，必須以電鏡或免疫學(xué)方法才能證明，稱為微莢膜（Microcapsule)，如溶血性鏈球菌的M蛋白、傷寒桿菌的Vi抗原及大腸桿菌的K抗原等。
圖2-7 肺炎球菌莢膜
大多數(shù)細(xì)菌（如肺炎球菌、腦膜炎球菌等)的莢膜由多糖組成。鏈球菌莢膜為透明質(zhì)酸；少數(shù)細(xì)菌的莢膜為多肽（如炭疽桿菌莢膜為D-谷氨酸的多肽)。
細(xì)菌一般在機(jī)體內(nèi)和營養(yǎng)豐富的培養(yǎng)基中才能形成莢膜。有莢膜的細(xì)菌在固體培養(yǎng)基上形成光滑型（S型)或粘液型（M)菌落，失去莢膜后菌落變?yōu)榇植谛停≧)。莢膜并非細(xì)菌生存所必需，如莢膜丟失，細(xì)菌仍可存活。醫(yī)學(xué)全在線網(wǎng)站www.med126.com
莢膜除對鑒別細(xì)菌有幫助外，還能保護(hù)細(xì)菌免遭吞噬細(xì)胞的吞噬和消化作用，因而與細(xì)菌的毒力有關(guān)。莢膜抗吞噬的機(jī)理還不十分清楚，可能由于莢膜粘液層比較光滑，不易被吞噬細(xì)胞捕捉之故。莢膜能貯留水分使細(xì)菌能抗干燥，并對其他因子（如溶菌酶、補(bǔ)體、抗體、抗菌藥物等)的侵害有一定抵抗力。
�。ǘ�)鞭毛（Flagllum)在某些細(xì)菌菌體上具有細(xì)長而彎曲的絲狀物，稱為鞭毛。鞭毛的長度常超過菌體若干倍。不同細(xì)菌的鞭毛數(shù)目、位置和排列不同，可分為單毛菌(Monotrichate)、雙毛菌(Amphitrichate)、絲毛菌(Lophotrichate)、周毛菌(Peritrichate)（圖2-8)。
圖2-8 細(xì)菌的鞭毛（示意)
鞭毛自細(xì)胞膜長出，游離于細(xì)胞外。用電子顯微鏡研究鞭毛的超微結(jié)構(gòu)，發(fā)現(xiàn)鞭毛的結(jié)構(gòu)分為：基礎(chǔ)小體、鉤狀體和絲狀體三個(gè)部分組成（圖2-9)。
圖2-9 大腸桿菌鞭毛根部結(jié)構(gòu)模式圖
1．基礎(chǔ)小體（Basalbody)位于鞭毛根部，埋在細(xì)胞壁中。革蘭氏陰性菌鞭毛的基礎(chǔ)小體由一根圓柱和兩對同心環(huán)所組成，一對是M環(huán)與S環(huán)，附著在細(xì)胞膜上；另一對是P環(huán)與L環(huán)，連在胞壁的肽聚糖和外膜上（M、S、P、L分別代表細(xì)胞膜、膜上、肽聚糖、外膜中的脂多糖)。革蘭氏陽性菌的細(xì)胞壁無外膜，其鞭毛只有M與S環(huán)而無P環(huán)和L環(huán)。鞭毛運(yùn)動(dòng)需要能量，細(xì)胞膜中的呼吸鏈可供其所需。
2．鉤狀體（Hook)位于鞭毛伸出菌體之處，呈鉤狀彎曲，鞭毛此轉(zhuǎn)變向外伸出，成為絲狀體。
3．絲狀體（Filament)呈纖絲狀，伸出于菌體之外，是由鞭毛蛋白亞單位呈緊螺旋狀纏繞而成的中空的管狀結(jié)構(gòu)。鞭毛蛋白是一種纖維蛋白，其氨基酸組成與骨骼肌動(dòng)蛋白相似，可能與鞭毛的運(yùn)動(dòng)性有關(guān)。
鞭毛是細(xì)菌的運(yùn)動(dòng)器官，往往有化學(xué)趨向性，常朝向有高濃度營養(yǎng)物質(zhì)的方向移動(dòng)，而避開對其在害的環(huán)境。常存在于桿菌及弧菌中。鞭毛的數(shù)量、分布可用以鑒別細(xì)菌。鞭毛抗原有很強(qiáng)的抗原性，通常稱為H抗原，對某些細(xì)菌的鑒定、分型及分類具有重要意義。
